Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA5O60264 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms