Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TO15178 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TO15178 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TO15178 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TO15178 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TO15178 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TO15178 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TO15178 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TO15178 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TO15178 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TO15178 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TO15178 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TO15178 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TO15178 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TO15178 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TO15178 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TO15178 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TO15178 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TO15178 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TO15178 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TO15178 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TO15178 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TO15178 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TO15178 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TO15178 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TO15178 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TO15178 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TO15178 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TO15178 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TO15178 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TO15178 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TO15178 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TO15178 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TO15178 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TO15178 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TO15178 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TO15178 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TO15178 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TO15178 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TO15178 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TO15178 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TO15178 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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