Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3FO00303 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3FO00303 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms