Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROB1E7EW31 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms