Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR3A8MPY1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms