Protein–RNA interactions for Protein: A6NDX5

ZNF840P, Putative zinc finger protein 840, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF840PA6NDX5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF840PA6NDX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF840PA6NDX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF840PA6NDX5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF840PA6NDX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF840PA6NDX5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF840PA6NDX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms