Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL33A6NCF5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL33A6NCF5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms