Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
VWA8A3KMH1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA8A3KMH1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms