Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC2BA2VCK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC2BA2VCK2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC2BA2VCK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms