Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM223A0PJW6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms