Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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