Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF1Q9Y4C2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCAF1Q9Y4C2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCAF1Q9Y4C2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms