Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPS28Q9Y2Q9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPS28Q9Y2Q9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPS28Q9Y2Q9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms