Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCTPQ9UKL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms