Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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