Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18L2Q9UHA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms