Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5BQ9UGL1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
KDM5BQ9UGL1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5BQ9UGL1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms