Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCOR3Q9P2K3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR3Q9P2K3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms