Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTR3BQ9P1U1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTR3BQ9P1U1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3BQ9P1U1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms