Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1BQ9NZR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LRP1BQ9NZR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1BQ9NZR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms