Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC27Q9NZQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms