Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX18Q9NVP1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX18Q9NVP1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms