Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA3Q9NST1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA3Q9NST1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA3Q9NST1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms