Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.4 ms