Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRC6CQ9HCJ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNRC6CQ9HCJ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNRC6CQ9HCJ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRC6CQ9HCJ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms