Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TBC1D2Q9BYX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBC1D2Q9BYX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBC1D2Q9BYX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBC1D2Q9BYX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBC1D2Q9BYX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBC1D2Q9BYX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TBC1D2Q9BYX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TBC1D2Q9BYX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TBC1D2Q9BYX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms