Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LSM14BQ9BX40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM14BQ9BX40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms