Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC106Q9BWC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms