Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD3Q9BV44 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD3Q9BV44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms