Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAF4Q9BUZ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF4Q9BUZ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms