Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms