Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms