Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF2Q99470 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms