Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CR12Q96Q35 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CR12Q96Q35 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms