Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GBP4Q96PP9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBP4Q96PP9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms