Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRC1Q96M27 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms