Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2E2Q96LR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E2Q96LR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E2Q96LR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms