Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP8Q96LD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP8Q96LD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP8Q96LD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP8Q96LD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP8Q96LD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP8Q96LD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP8Q96LD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms