Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms