Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD1Q8NHV4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD1Q8NHV4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD1Q8NHV4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms