Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F8

ZNF454, Zinc finger protein 454, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF454Q8N9F8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF454Q8N9F8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF454Q8N9F8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF454Q8N9F8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms