Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVBPQ8N300 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVBPQ8N300 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms