Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCUBE3Q8IX30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCUBE3Q8IX30 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms