Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHERPQ8IWX8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHERPQ8IWX8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms