Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOX2Q8IUF8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOX2Q8IUF8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOX2Q8IUF8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOX2Q8IUF8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms