Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMS2Q7Z4I7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIMS2Q7Z4I7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMS2Q7Z4I7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMS2Q7Z4I7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms