Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLPSL2Q6UWE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms