Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TSSK4Q6SA08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK4Q6SA08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK4Q6SA08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms