Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC62Q6P9F0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC62Q6P9F0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms