Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGSNQ5TDP6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms